Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ubxn4Q8VCH8 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms