Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg4aQ8C9S8 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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