Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms