Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Cnot7Q60809 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms