Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Shank3Q4ACU6 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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