Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm42903-201ENSMUST00000202607 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Anapc15-ps-202ENSMUST00000218771 399 ntAPPRIS P5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Pdzrn4-201ENSMUST00000035399 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Plekha8-201ENSMUST00000101385 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14141-201ENSMUST00000120236 783 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Hdhd2-207ENSMUST00000147332 1705 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms