Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.3 ms