Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms