Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Rps29P62274 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms