Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cux1P53564 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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