Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RxraP28700 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RxraP28700 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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