Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Vpreb1P13372 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms