Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clip3B9EHT4 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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