Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Usf3B2RUQ2 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms