Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprbB2RU80 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms