Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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