Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.8 ms