Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-M5A7VMS3 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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