Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms