Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms