Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rnft1Q9DCN7 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms