Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms