Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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