Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rprd1bQ9CSU0 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Rprd1bQ9CSU0 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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