Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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PtprtQ99M80 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprtQ99M80 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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