Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms