Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Nhlrc3Q8CCH2 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms