Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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