Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Gm28047Q3US59 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Gm28047Q3US59 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms