Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Yipf3Q3UDR8 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Yipf3Q3UDR8 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms