Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms