Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Top2aQ01320 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms