Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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