Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RxraP28700 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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