Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RhoP15409 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RhoP15409 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RhoP15409 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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