Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm14188-201ENSMUST00000105060 168 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Uqcc2-202ENSMUST00000118613 426 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm11534-202ENSMUST00000129261 470 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Cox6c-201ENSMUST00000014457 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Mir8100-201ENSMUST00000184230 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm27483-201ENSMUST00000184983 71 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 1700022H16Rik-201ENSMUST00000188935 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm28038F7BCN9 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm28038F7BCN9 Rpl32-201ENSMUST00000081840 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm28038F7BCN9 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Dixdc1-206ENSMUST00000120622 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm28038F7BCN9 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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