Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rabgef1Q9JM13 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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