Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rb1cc1Q9ESK9 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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