Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Usp29Q9ES63 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp29Q9ES63 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp29Q9ES63 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp29Q9ES63 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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