Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms