Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc47Q9D024 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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