Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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PtprtQ99M80 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprtQ99M80 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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