Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Top1mtQ8R4U6 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Top1mtQ8R4U6 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Top1mtQ8R4U6 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Top1mtQ8R4U6 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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