Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg4aQ8C9S8 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Atg4aQ8C9S8 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg4aQ8C9S8 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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