Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms