Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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