Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trafd1Q3UDK1 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms