Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pkp1P97350 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pkp1P97350 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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