Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PctpP53808 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms