Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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VdrP48281 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VdrP48281 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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VdrP48281 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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VdrP48281 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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VdrP48281 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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VdrP48281 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VdrP48281 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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